Application Note SpectraMax i3x マルチモードマイクロプレートリーダーに
搭載されたNanoBRETテクノロジー
- 生理学的に適切なシステムでタンパク質間相互作用の誘導と阻害を研究
- 従来のBRETアッセイと比較して、シグナルを増加させ、バックグラウンドを低下させます。
- SpectraMax i3x用のNanoBRET検出モジュールは、高感度を必要とするアッセイに最適です。
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はじめに
キャシー・オルセン博士|Sr.アプリケーションサイエンティスト|モレキュラー・デバイス
タンパク質間相互作用(PPI)は、細胞機能やシグナル伝達に不可欠である。PPIを研究するために、共免疫沈降法やプルダウン法、蛍光共鳴エネルギー移動法(FRET)などの蛍光法など、多くの方法が採用されてきた。蛍光法はレーザーや高出力ランプによる試料の励起に依存するため、しばしば光退色やバックグラウンド蛍光の問題が生じやすく、有用性が制限されることがある。別の方法である生物発光共鳴エネルギー転移(BRET)は、酵素ルシフェラーゼによって触媒される化学反応を利用して光を発生させる。光励起がないため、BRETは外部光源によるサンプル照明がもたらす問題を回避できる。
プロメガ社のNanoBRET™テクノロジーは、NanoLuc® LuciferaseをBRETドナーとして、NanoBRET 618蛍光体で標識されたHaloTag®タンパク質をアクセプターとして使用します。赤色シフトしたアクセプターは、ドナーとアクセプターの発光スペクトルの重なりを減らし、ドナーとしてレニラ・ルシフェラーゼ、アクセプターとしてYFPまたはGFPを用いる他のBRET法よりも優れたSN比を可能にします。
ここでは、SpectraMax® i3x マルチモードマイクロプレートリーダーのNanoBRETアッセイでの検証を示します。オンボードのルミネッセンス検出モードを使用することもできるが、より高い感度を得るために、定量下限を4倍向上させるNanoBRET検出カートリッジをリーダーに装備することもできる。
材料
- 白色96ウェルプレート
- 0.1%ウシ血清アルブミン(BSA)を封じ込めた1Xリン酸緩衝生理食塩水(PBS)
- NanoBRET Control タンパク質パネル - 以下の分画量を5バイアル:
◦NanoBRETコントロールタンパク質1:0
◦NanoBRET コントロールプロテイン2:0.1
◦NanoBRET コントロール タンパク質 3: 1
◦NanoBRET コントロール タンパク質 4: 10
◦NanoBRET コントロールタンパク質 5: 100 - NanoBRET Nano-Glo基質(NanoBRET検出システムの一部)
- SpectraMax i3x マルチモードマイクロプレートリーダー
- NanoBRET検出カートリッジ
方法
プロメガ社から提供された NanoBRET コントロールタンパク質を用いた in vitro プロトコルを実行してインストゥルメンテーションを検証し、検出限界を推定した。NanoBRET活性タンパク質を封じ込めた標準品を96穴ソリッド白色マイクロプレートにプレーティングし、NanoBRET測定を行った。これらの測定値を用いて線形回帰計算を行い、機器性能を測定する定量下限(LOQ)値を算出しました。
検証法はSpectraMax i3xリーダーでカスタムNanoBRET検出カートリッジまたはオンボードルミネッセンス検出光学系のいずれかを用いて実行した。両方の結果を示す。
アッセイ法
- コントロールタンパク質 50 µL を 96-well プレート内のトリプリケートウエルに分注する。
- NanoBRET Nano-Glo Substrate の 20 µM 溶液を 1X PBS/0.1% BSA に調製する(5 mM のストック試薬を 250 倍希釈)。
- 各ウェルに 50 µL の基質を添加し、最終濃度を 10 µM とする。
- 基質添加後 10 分以内に NanoBRET 対応ルミノメーターでドナー発光(例 450nm)とアクセプター発光(例 610nm)を測定する。
データ分析
- 以下の式で NanoBRET 比を求める: アクセプターサンプル / ドナーサンプル .
- 各データの平均 NanoBRET 比と SD を決定する: 0%、0.1%、1%、10%、100%。
- 0%セットの平均比率を他のすべてのセットから引き、補正した NanoBRET 比率を求めます。
- 補正した NanoBRET 比をプロットし、線形回帰分析を行って傾きを計算する。曲線はx,y = 0を強制的に通るようにする(アクセプター非存在下ではBRETが起こらないため)。
- 定量限界(LOQ)を計算する。これは、全ドナー集団に対するBRETペアの最小割合(占有率)を表し、ドナーのみと統計的に区別できる: LOQ = (10 * SD 0% sample )/slope.
結果/結論
NanoBRET 検出モジュールを用いた SpectraMax i3x リーダーの LOQ は 0.58%であった(図 1)。オンボード発光検出モードを用いた場合のLOQは2.6%であった。NanoBRET 検出モジュールは感度が高いのでシグナルが弱いアッセイに有効である。
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